Хомяк может начать лысеть, чесаться, из-за аллергии или грибка. Возможно наличие паразитов. Обратитесь в ветеринарную клинику, для осмотра под лампой, возможно, сдачи соскоба с кожи.
Попробуйте пересмотреть рацион хомяка. Какие продукты он ест. Что используется в качестве подстилки. Давайте витамины для грызунов.
Подобный вопрос и ответ на него - http://www.zooserver.ru/gryzuny_drugoe/view/2767/