Необходимо провести клинический осмотр и лабораторное исследование для исключения паразитарной этиологии. Возможно, у свинки индивидуальная чувствительность к прикосновениям (такое у свинок бывает).
Покажите морскую свинку ветеринарному врачу (очно). Свинке может и не нравиться, когда ее там трогают. Попробуйте взять в руки и посмотреть, что ее там беспокоит.