Какая, по-вашему, обычная подстилка? Нормальная подстилка - это именно опилки, но лучше всего гранулы, ими хомяк не уколет ту же попу. В идеале кукурузный наполнитель. Питомцы должны полкучать все лучшее, иначе зачем и брать их.
По поводу семенников. У сирийцев они большие. Но ваш джунгарский, у него семенники не ярко выражены, особенно в таком возрасте трудно определить пол без навыка. Поэтому пропоите рисовым отваром, если подозреваете понос, и соблюдайте гигиену. Хорошо помогает веракол - он одинаково эффективен и при поносах, и при запорах, отрегулирует работу кишечника. По капле 3 раза в сутки до нормализации стула.
Кормление и содержание хомячков лучше сразу наладить правильно, чтобы не провоцировать другие серьезные заболевания. Начните с этого материала, а дальше и остальные вам в помощь
http://www.hrumik.ru/blogs/hrumik/165-khoc hu-vse-znat-o-khomyakakh

Опилки - еще раз повторяю - только усугубляют содержание - они острые, а у хомячка болит там, чем он ползает по опилкам (элементарно же!) и поэтому он хочет «выкусить», устранить боль. У вас получается замкнутый круг. Сначала надо исключить эту проблему, а потом смотреть дальше. Постелите тогда бумажные полотенца, пока не нормализуется состояние. И обмывайте ромашкой и хлоргексидином (продается в аптеке). Убедитесь, что рацион правильный (ссылку я дала, не поленитесь - многие уверены, что все знают, а на самом деле ничего не знают). Понаблюдайте за результатом. Тогда уже и напишете о состоянии.