Навсегда рассадить животных в отдельные клетки ......и почитать о правилах содержания хомяков.....на специализированных сайтах (скажем, Hamster.ru) этому посвящены отдельные разделы.

Самка просто очень сильно нервничает. Если Вы какое-то время не будете её трогать и не подсадите самца к ней обратно, она должна будет скоро успокоиться. Держать хомяков парами и группами, независимо от пола и родства, категорически нельзя.
Я так понимаю, она с самцом уже жила какое-то время в одной клетке? И не пыталась его убить? Если это так, и сейчас её поведение неожиданно сменилось на агрессию, она может быть беременной.

Хомяки территориальные животные. Содержание двух или более хомяков в одной клетке – НЕ ДОПУСТИМО!

 

Ссаживают самку с самцом, на вязку, только в период охоты. Когда самка показывает готовность к спариванию характерными звуками и поведением. Самку подсаживают в клетку к самцу. После отсаживают обратно в ее клетку.

 

Чаще всего, самки хомяков ведут себя агрессивно по отношению к самцу. Редко когда самец. Такой раздел территории заканчивается смертью одного из хомяков.

 

Если самка находилась с самцом, она может быть беременной. К тому же, частые роды не благотворно влияют на здоровье самки. В стрессовых ситуациях самка хомяка может избавиться от потомства.

 

Хомяки. Содержание, кормление, разведение - http://msvinka.ru/homopi.html