Сколько дней вы кололи антибиотик? У крыс антибиотики при респираторных проблемах применяются курсом не менее 2 недель, к тому же гентамицин - не лучший выбор.
Возможно ухудшение состояния связано с отменой антибиотика, а не эуфиллина. Лучше сделать актуальный рентген. Эуфиллин давать можно, если ему на нем легче, но это не влияет на устранение причины заболевания.