Этому могло послужить несколько факторов: недостаток белка в рационе во время беременности и после родов, стресс, нежизнеспособность потомства, врожденные заболевания. Вообще поедание части потомства для хомяков не редкость. Если она выкармливает оставшихся хомячков, не беспокойте ее, не подвергайте стрессу.

Здравствуйте, Алена!

Возможно, потомство было не жизнеспособным. Так же могут влиять другие факторы.

    

Для того чтобы самка не поела потомство:
   - хомяки должны содержаться по отдельности;
   - возраст самки должен подходить для разведения – не менее 4 мес. и не более 10 мес.;
   - условия содержания и рацион должны находиться на должном уровне;
   - беременную самку, за несколько дней до родов и кормящую, нельзя беспокоить, пугать, стараться взять в руки и т.д.;
   - клетку нужно убрать в тихое и затененное место, где самка будет чувствовать себя в безопасности.

Беременность и роды у хомяков - http://msvinka.ru/hom2.html