Если ваши врачи подозревают иерсиниоз, пусть делают соответствующие анализы, включая бактериологическое исследование, ИФА. Все остальное - это гадание на кофейной гуще и нежелание нормально работать.
Хомяк скорее всего вообще не при чем, носительство очень маловероятно, тем более если хомяк из магазина, а не в степи подобран был. Тем не менее, старайтесь не контактировать с ним в период болезни - ограничьтесь выдачей корма и воды. Раз уж неизвестно, чем вы больны, хомяк сам не застрахован от заражения.