Нужно время,чтобы собака привыкла к Вашему сыну.Пусть он больше  играет с собакой,объясните ему,что кричать на собаку нельзя,она такая же маленькая,как и он,обижать,дразнить,бить,щипать ее тоже нельзя.Используйте ситуацию,когда Вам некогда,а собака требует внимания,отправьте ее к сыну: "Иди к Илюшке и поиграй с ним(имя вымышленное)",а сынишка в это время пусть завлечет ее игрушкой. И пусть он ее не боится.Сын,конечно,тоже не велик,но как правило собака и ребенок в семье очень быстро находят общий язык,если взрослые не будут нервничать и суетиться по пустякам.Им надо привыкнуть друг к другу! Когда они на едине,следите за ними из-за угла и будьте справедливы.У Вас теперь два ребенка и обоих надо воспитывать!