Здравствуйте!
Желательно обратиться к ветеринарному врачу - Ратологу, это может быть начало грибкового заболевания (шелушатся лапки). 
 
Против внешних паразитов для морских свинок подходят препараты только для котят, если не найдете препараты предназначающиеся именно для грызунов.